Está constituida por tres departamentos:

• Del Medio Físico Biótico
• Del Medio Socioeconómico
• De Integración y seguimiento de estudios

Sus funciones son:

• Coordinar impulsar y apoyar la elaboración del programa de ordenamiento ecológico general del territorio.

• Coordinar la formulación de las bases técnicas y metodológicas para la elaboración de los programas de ordenamiento ecológico general del territorio y locales.

• Articular los procesos y resultados para la integración del medio físico, biótico y socioeconómico, con la finalidad de construir diagnósticos integrados con una clara definición territorial en el país, y que además sirvan de base para la formulación del modelo de ordenamiento ecológico general del territorio.

• Coordinar la elaboración del modelo del ordenamiento ecológico general del territorio, como instrumento de expresión territorial de las políticas y criterios ecológicos.

• Propiciar la elaboración e instrumentación de métodos y técnicas para la generación y sistematización de los indicadores más útiles en la realización de diagnósticos y monitoreos del territorio nacional.

• Propiciar la participación en espacios de investigación, así como la elaboración de documentos de difusión en materia de ordenamiento ecológico general del territorio y local.

• Propiciar la participación de otras instancias de la SEMARNAT y demás actores requeridos para la realización técnica de los programas de ordenamiento ecológico general del territorio y local.

• Propiciar la elaboración de estudios y proyectos que apoyen los programas de ordenamiento ecológico general del territorio y locales.

• Integrar propuestas conceptuales y técnicas así como información que faciliten la elaboración de los programas de ordenamiento ecológico general del territorio y locales.

• Validar técnicamente los estudios que integran los programas de ordenamiento ecológico general del territorio y locales, para garantizar el cumplimiento de estándares mínimos, al nivel técnico y metodológico de los instrumentos de política ambiental.